MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 168 chromosome

Total Repeats: 4649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017509	T	6	6	1447	1452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017509	TTA	2	6	1469	1474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017509	ATT	2	6	1480	1485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017509	TAAA	2	8	1491	1498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017509	ATATA	2	10	1509	1518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017509	ATT	2	6	1519	1524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017509	A	9	9	1553	1561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017509	T	8	8	2696	2703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017509	A	8	8	2715	2722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017509	A	7	7	2746	2752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017509	A	6	6	7061	7066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017509	T	6	6	7091	7096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017509	T	8	8	7099	7106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017509	A	8	8	7118	7125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017509	TGG	2	6	7133	7138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017509	ATT	2	6	7737	7742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017509	A	6	6	7760	7765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017509	TAATTT	2	12	7767	7778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017509	TAA	2	6	7785	7790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017509	T	7	7	7822	7828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017509	A	6	6	7842	7847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017509	CTTT	2	8	7916	7923	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017509	T	6	6	7921	7926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017509	CAAA	2	8	7927	7934	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017509	A	8	8	7947	7954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017509	TGA	2	6	7966	7971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017509	GAA	2	6	7982	7987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017509	AGA	2	6	7990	7995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017509	TAA	2	6	8001	8006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017509	AAT	2	6	8038	8043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017509	AAT	2	6	8081	8086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017509	AAT	2	6	8104	8109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017509	T	7	7	8190	8196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017509	ACT	2	6	8225	8230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017509	CG	3	6	8245	8250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017509	A	7	7	8269	8275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017509	GCT	2	6	8288	8293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017509	AGC	2	6	8305	8310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017509	A	6	6	8430	8435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017509	T	6	6	8830	8835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017509	T	6	6	8871	8876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017509	T	6	6	8881	8886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017509	AATAA	2	10	8888	8897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017509	A	8	8	8896	8903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017509	A	8	8	8908	8915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017509	TAAA	2	8	8926	8933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017509	ATTT	2	8	8951	8958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017509	T	6	6	11015	11020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017509	A	7	7	11021	11027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017509	T	6	6	11070	11075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017509	TAT	2	6	16494	16499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017509	TTA	2	6	16502	16507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017509	TAAT	2	8	16893	16900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017509	T	8	8	16900	16907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017509	TA	4	8	16920	16927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017509	T	6	6	16934	16939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017509	T	6	6	16985	16990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017509	TA	3	6	17009	17014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017509	ATT	2	6	17019	17024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017509	AAT	2	6	17053	17058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017509	AAT	2	6	17138	17143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017509	T	6	6	17197	17202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017509	ATTA	2	8	17445	17452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017509	ACCA	2	8	17465	17472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017509	AAT	2	6	17504	17509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017509	AAT	2	6	17531	17536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017509	T	7	7	17547	17553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017509	ATT	2	6	17560	17565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017509	A	7	7	19884	19890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017509	T	7	7	19891	19897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017509	GTA	2	6	19901	19906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017509	TTAA	2	8	19918	19925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017509	AAT	2	6	19926	19931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017509	TCC	2	6	22435	22440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017509	T	7	7	22451	22457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017509	TAT	2	6	22475	22480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017509	TAT	2	6	22483	22488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017509	T	6	6	22507	22512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017509	TAA	3	9	22523	22531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017509	ACA	2	6	22569	22574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017509	ATT	2	6	22599	22604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017509	A	6	6	22618	22623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017509	A	6	6	22847	22852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017509	A	8	8	22865	22872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017509	A	6	6	22879	22884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017509	TTA	2	6	22885	22890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017509	ATT	2	6	22917	22922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017509	ATTA	2	8	22928	22935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017509	T	6	6	22948	22953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017509	A	6	6	22971	22976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017509	ATT	2	6	22982	22987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017509	ATC	2	6	23018	23023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017509	TGA	2	6	23082	23087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017509	TAT	2	6	23122	23127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017509	TTGT	2	8	23128	23135	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017509	CAA	2	6	23155	23160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017509	TGTT	2	8	23194	23201	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017509	T	7	7	23232	23238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017509	T	6	6	23280	23285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017509	TTA	2	6	23299	23304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017509	ATA	2	6	23336	23341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017509	TCA	2	6	23364	23369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017509	T	6	6	23402	23407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017509	ATG	2	6	23498	23503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017509	TTAC	2	8	23538	23545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017509	TTG	2	6	23554	23559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017509	T	7	7	23599	23605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017509	T	7	7	23611	23617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017509	A	6	6	23626	23631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017509	T	7	7	23641	23647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017509	TAA	2	6	23677	23682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017509	T	7	7	23752	23758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017509	A	6	6	23760	23765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017509	TCA	2	6	23772	23777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017509	AATTA	2	10	23786	23795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017509	T	8	8	23806	23813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017509	A	8	8	23818	23825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017509	ATT	2	6	23879	23884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017509	T	6	6	23883	23888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017509	ATATT	2	10	23958	23967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017509	T	6	6	23991	23996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017509	ACC	2	6	24029	24034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017509	GAA	2	6	24035	24040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017509	TAA	2	6	24059	24064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017509	A	8	8	24098	24105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017509	A	6	6	24132	24137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017509	CT	3	6	24183	24188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017509	T	7	7	24198	24204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017509	T	6	6	24206	24211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017509	AAC	2	6	24296	24301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017509	GTTTT	2	10	24309	24318	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017509	T	6	6	24315	24320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017509	T	7	7	24326	24332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017509	TCA	2	6	24363	24368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017509	GGTT	2	8	24377	24384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017509	TAAAA	2	10	24392	24401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017509	CCA	2	6	24450	24455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017509	TTG	2	6	24470	24475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017509	TTTTCA	2	12	24483	24494	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_017509	A	6	6	24501	24506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017509	T	6	6	24514	24519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017509	ATT	2	6	24572	24577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017509	T	6	6	24576	24581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017509	T	7	7	24636	24642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017509	T	8	8	24644	24651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017509	A	6	6	24659	24664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017509	TTA	2	6	24684	24689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017509	AATTA	2	10	24701	24710	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017509	TTATT	2	10	24754	24763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017509	AATT	2	8	24778	24785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017509	TAT	2	6	25710	25715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017509	A	15	15	25734	25748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017509	AGA	2	6	25763	25768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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